Novela zaměřená na reformu dohledu nad kvalitou vysokých škol by měla tento dohled posunout na světovou úroveň, avšak podle současných návrhů svého cíle nedosahuje. Zástupci vysokých škol vyjádřili v úvodních neformálních konzultacích značné výhrady k navrhovaným změnám v rámci Národního akreditačního úřadu. Kritizují zejména rychlý postup ministerstva a upozorňují na nutnost širší diskuze.

Klíčovým cílem novely je posílit nezávislost Národního akreditačního úřadu a transformovat ho do agentury, která by odpovídala mezinárodním standardům a umožnila by České republice začlenit se do Evropského registru zajišťování kvality ve vysokém školství (EQAR). Tento krok by mohl vést ke zlepšení spolupráce českých univerzit se zahraničními institucemi. Nicméně, představitelé vysokých škol vyjadřují pochybnosti, zda předložený návrh tyto cíle skutečně naplňuje.

Česká konference rektorů sice podporuje myšlenku transformace Národního akreditačního úřadu na nezávislou akreditační instituci, avšak vyjadřuje obavy, že novela v současné podobě tento cíl nesplní, a apeluje na důkladnější projednání problematiky. Rektorům také vadí, že novela byla předložena bez důkladné analýzy současného stavu akreditačních mechanismů, a kritizují ministerstvo za uspěchaný postup, který neumožňuje hlubší diskusi o tak zásadních změnách. Ministerstvo již však připravuje paragrafové znění.

Konference rektorů dále vyjádřila nesouhlas s nečekaným návrhem zahrnout do akreditačního řízení také vyšší odborné školy, což podle ní může významně ovlivnit kvalitu vzdělávání a financování vysokých škol. Rektorátní konference považuje za klíčové, aby se návrh důkladně prodiskutoval, a doporučuje ho nepředkládat do další fáze legislativního procesu.

Podobně se vyjádřila i Rada vysokých škol. I když rada podporuje myšlenku reformy, pochybuje o tom, zda navrhované změny statutu a fungování akreditačního orgánu skutečně zajistí jeho soulad s evropskými standardy, což by bylo nezbytné pro plné zapojení českých vysokých škol do mezinárodního vzdělávacího prostoru.

Rada rovněž kritizuje nedostatek analýz týkajících se současného stavu a možných změn, i přesto, že studie na toto téma existují. Stejně jako konference rektorů, i rada byla překvapena zařazením vyšších odborných škol do systému akreditací, což původní návrh Národního akreditačního úřadu nezahrnoval.